41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4427 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 297 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  70.03 
 
 		 297 aa  411  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  56.9 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  44.71 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  45.14 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  50 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  44.25 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  43.38 
 
 		 301 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  44.83 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  40.73 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  31.65 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  31.21 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  30.23 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  29.15 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.05 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.98 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  31.64 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  42.39 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.598852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  31.6 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  29.32 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  29.44 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  23.93 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  34.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  34.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  34.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  34.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  34.57 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  34.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  34.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  36.23 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  32.76 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  38.96 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>