31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1265 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  59.48 
 
 
283 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  46.53 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  40.59 
 
 
288 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  35.29 
 
 
290 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  34.75 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  35.86 
 
 
288 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  34.72 
 
 
290 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  36.3 
 
 
288 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  33.7 
 
 
290 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  29.97 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  31.54 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  30.03 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  27.76 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  29.33 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.64 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  30.21 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  29.5 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  25.74 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  25.19 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  30.82 
 
 
363 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  27.94 
 
 
295 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  25.74 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  30 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  32.18 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>