25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0933 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  560  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  98.26 
 
 
288 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  44.67 
 
 
290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  46.21 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  45.36 
 
 
288 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  46.05 
 
 
290 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  45.02 
 
 
290 aa  208  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  35.54 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  36.26 
 
 
288 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  27.93 
 
 
294 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  29.35 
 
 
296 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
301 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.78 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  27.53 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  25.11 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  23.08 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3745  hypothetical protein  20.08 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  23.1 
 
 
304 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32491  predicted protein  23.68 
 
 
363 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  27.52 
 
 
309 aa  42  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>