22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1627 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  575  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1542  hypothetical protein  40.61 
 
 		 324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  31.5 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  32.31 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  28.39 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  32.79 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  23.92 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.47 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  25.82 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  28.06 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  27.46 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  24.5 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  27.73 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.98 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  24.83 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  26.89 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  23.55 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>