28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1468 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15751  hypothetical protein  86.55 
 
 
290 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  85.52 
 
 
290 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  72.16 
 
 
291 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14661  hypothetical protein  46.86 
 
 
288 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0933  hypothetical protein  44.22 
 
 
288 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17901  hypothetical protein  44.22 
 
 
288 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  35.29 
 
 
288 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12541  integral membrane protein, DUF6  32.99 
 
 
293 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.442569 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1217  hypothetical protein  35.86 
 
 
283 aa  142  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  29.02 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  26.03 
 
 
294 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.92 
 
 
301 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  28.09 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  34.52 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.55 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0408  hypothetical protein  28.27 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  25.1 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 
297 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  24.23 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  29.46 
 
 
298 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  22.69 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.82 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.51 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  26.87 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  21.95 
 
 
297 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>