28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2973 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
320 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.626562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0807  hypothetical protein  47.48 
 
 
304 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  32.59 
 
 
303 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
296 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.08 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  29.39 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2183  hypothetical protein  28.93 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  33.47 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  27.73 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  25.64 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  26.86 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  24.6 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  21.15 
 
 
290 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2786  integral membrane protein  25.24 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4052  hypothetical protein  24.46 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  32.26 
 
 
304 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  21.15 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  26.78 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15601  hypothetical protein  20.83 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.45516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  27 
 
 
294 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.598852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.45 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>