13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0408 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0408  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  28.27 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05113  hypothetical protein  21.35 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  23.99 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.54 
 
 
301 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15391  hypothetical protein  23.94 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.207546  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  25.4 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  26.42 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  25.91 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  26.28 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0116  hypothetical protein  24.32 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.887473  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4427  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 
297 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  18.87 
 
 
296 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>