11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1542 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1542  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1627  hypothetical protein  40.24 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0925  hypothetical protein  26.73 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  25.75 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  24.08 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002248  permease  23.08 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.214226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0236  hypothetical protein  25.29 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>