77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0186 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
287 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  63.82 
 
 
293 aa  371  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  55.88 
 
 
138 aa  153  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  54.41 
 
 
137 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.15 
 
 
138 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.68 
 
 
144 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.74 
 
 
137 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.24 
 
 
137 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.53 
 
 
138 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.47 
 
 
137 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.11 
 
 
137 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.15 
 
 
143 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  45.99 
 
 
140 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.64 
 
 
141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  51.15 
 
 
143 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  48.51 
 
 
145 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  44.36 
 
 
145 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 
145 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  44.2 
 
 
144 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  46.27 
 
 
142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  45.8 
 
 
146 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  46.21 
 
 
145 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.21 
 
 
145 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  44.78 
 
 
141 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  44.78 
 
 
142 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.72 
 
 
153 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  46.92 
 
 
144 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.8 
 
 
145 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.86 
 
 
137 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  46.61 
 
 
145 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  39.86 
 
 
145 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.55 
 
 
145 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.73 
 
 
143 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  41.22 
 
 
145 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  43.38 
 
 
142 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  48.62 
 
 
145 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.91 
 
 
142 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.65 
 
 
137 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.8 
 
 
145 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  45.45 
 
 
146 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  44.63 
 
 
143 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  44.63 
 
 
143 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  44.63 
 
 
143 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.07 
 
 
146 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  37.1 
 
 
139 aa  89.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  42.06 
 
 
142 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  42.06 
 
 
142 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  42.74 
 
 
142 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  42.74 
 
 
142 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  41.27 
 
 
142 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  41.88 
 
 
142 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  41.03 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  41.03 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  41.03 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  41.03 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  41.03 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  41.03 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  41.03 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  41.03 
 
 
142 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.71 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  45.37 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  41.61 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  41.61 
 
 
142 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.83 
 
 
142 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  29.08 
 
 
147 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1604  hypothetical protein  28.68 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  21.84 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1228  hypothetical protein  24.78 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  28.8 
 
 
158 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  24.76 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.66 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  24.12 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
137 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.22 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  28.69 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>