More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2593 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  567  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  86.87 
 
 
297 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  73.45 
 
 
306 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  44.57 
 
 
296 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.37 
 
 
293 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  38.16 
 
 
305 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  39.6 
 
 
307 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.24 
 
 
305 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.92 
 
 
305 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.67 
 
 
294 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  40.53 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  40.5 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  37.1 
 
 
299 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  34.41 
 
 
289 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  35.46 
 
 
295 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  37.5 
 
 
283 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  41.55 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  37.2 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  36.97 
 
 
300 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  40.7 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  35.96 
 
 
298 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  39.45 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  37.86 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.24 
 
 
307 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  35.34 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.28 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  42.24 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  34.49 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  38.57 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  37.5 
 
 
293 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.1 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  33.45 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  36.21 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
299 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.29 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.64 
 
 
296 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.77 
 
 
296 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  36.23 
 
 
281 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
299 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  32.63 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  35.53 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.64 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 
299 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  33.68 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  33.8 
 
 
286 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  33.22 
 
 
289 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  32.64 
 
 
325 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.35 
 
 
304 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  31.51 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  34.53 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  31.29 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  32.51 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  32.51 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  33.92 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  33.81 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
313 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  35.84 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  31.45 
 
 
310 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  33.94 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  35.21 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  35.21 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  35.21 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  33.57 
 
 
301 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  33.57 
 
 
301 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  33.93 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  33.57 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  33.57 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  33.57 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  33.57 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  32.74 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  32.88 
 
 
304 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  32.49 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  34.42 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  34.42 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.69 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  34.53 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  33.69 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  32.97 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  28.17 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  32.66 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  32.97 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  32.17 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.23 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  35.48 
 
 
287 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  34.77 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  34.77 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  34.77 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  35.48 
 
 
287 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  34.77 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  35.48 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  39.44 
 
 
365 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  31.71 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.29 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>