40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1359 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.97 
 
 		 137 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.91 
 
 		 144 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  28.15 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.02 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  29.93 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0071  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 299 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 293 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  29.03 
 
 		 300 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  30.16 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  28.23 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  23.62 
 
 		 299 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  31.69 
 
 		 293 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  29.51 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  31.48 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  30.25 
 
 		 142 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  30.48 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 310 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  30.48 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  27.73 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  30.48 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>