15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2682 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2682  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
305 aa  580  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00531158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0071  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1055  hypothetical protein  30.74 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.268059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  28.17 
 
 
338 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.598852  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  30.6 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  29.9 
 
 
310 aa  45.8  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  29.88 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  31.62 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
137 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  21.76 
 
 
284 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  32.26 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 
303 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>