42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2134 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  64.29 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  50.18 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  46.18 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  46.18 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  36.52 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  35.59 
 
 		 126 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  35.83 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  34.17 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  32.5 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  31.06 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  31.67 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  32.2 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  35.09 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2321  hypothetical protein  36.19 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  32.71 
 
 		 150 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  31.76 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  30.23 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  31.76 
 
 		 159 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  38.16 
 
 		 123 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  38.46 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.31 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  40.91 
 
 		 141 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.31 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  36 
 
 		 123 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  28.41 
 
 		 121 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.39 
 
 		 118 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  31.03 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  34.85 
 
 		 123 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  34.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.33 
 
 		 123 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  38.6 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>