59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0880 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  99.21 
 
 		 126 aa  246  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  78.4 
 
 		 126 aa  207  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  80.49 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  80.49 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  73.39 
 
 		 146 aa  196  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  72.58 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  38.14 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  37.4 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  41.13 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  33.61 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  33.66 
 
 		 249 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  33.66 
 
 		 249 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  33.96 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  36.19 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2321  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  32.74 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  45.76 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  31.09 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  31.62 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  28.69 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  26.23 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  33.8 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  27.05 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  27.05 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  27.05 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  34.67 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  26.67 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  26.5 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  28 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  28 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  29 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  36.04 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  30.34 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  39.66 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  31.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  30.43 
 
 		 277 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  27.62 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  30.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>