42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1412 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  100 
 
 		 338 aa  660    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  40.9 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  36.36 
 
 		 362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  39.64 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  32.57 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  31.62 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  30.89 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.95 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  28.84 
 
 		 369 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  27.94 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  27.94 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  30.65 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  25.87 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  27.16 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  30.08 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  28.74 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  27.04 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  25.56 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  29.71 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0999  hypothetical protein  25.78 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0570483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.49 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 347 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  24.76 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  25.24 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  22.01 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  22.36 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  27.64 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  31.03 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  22.88 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  31.15 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  29.67 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.05 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  29.67 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  29.67 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  23.38 
 
 		 294 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>