18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2432 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  724    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  74.25 
 
 
370 aa  562  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  45.82 
 
 
362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  42.86 
 
 
359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  44.78 
 
 
365 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  27.93 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  26.88 
 
 
343 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
342 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  26.48 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  27.44 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  27.89 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  26.13 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  26.4 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  25 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  25.4 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  22.34 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  26.12 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>