24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2349 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 342 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  35.15 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  34.23 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  32.46 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  29.6 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  29.28 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  31.19 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  31.58 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  28.71 
 
 		 365 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  28.74 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  26.75 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  29.79 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  28.92 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  30.8 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  30.64 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  28.84 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  27.61 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  29.72 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0999  hypothetical protein  27.68 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0570483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  30.95 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  25.87 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.56 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.04 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>