25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0941 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  59.82 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  40.54 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  36.68 
 
 		 322 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  36.88 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.15 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  42.38 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.38 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  32.77 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  35.74 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  29.08 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  28.14 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  29.08 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  29.57 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  27.54 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  29.26 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  26.88 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  29.89 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  28.94 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  31.85 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  21.73 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 137 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  21.79 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  22.76 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>