19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1354 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  715    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  62.36 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  56.94 
 
 		 362 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  47.55 
 
 		 370 aa  299  6e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  44.78 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  31.62 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  28.14 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  30.04 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  27.92 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  27.87 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  25.45 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  25.45 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  25.08 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  25.48 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  26.21 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  28.19 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  27.46 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>