18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14730 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  728    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  74.25 
 
 		 369 aa  562  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  49.59 
 
 		 362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  45.98 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  47.01 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  30.16 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  29.08 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.02 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  29.06 
 
 		 322 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  29.06 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  27.06 
 
 		 346 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  25.42 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  28.57 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  24.85 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  25.65 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  25.21 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  22.53 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>