22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1367 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  100 
 
 		 348 aa  682    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  77.87 
 
 		 347 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  67.24 
 
 		 348 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  32.85 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  29.57 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  26.14 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  26.44 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  29.04 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  27.49 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  27.33 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  26.46 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  26.82 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  24.85 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  28.19 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  20.73 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  26.86 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  23.11 
 
 		 289 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.05 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>