44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0975 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  100 
 
 		 346 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  59.25 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  39.71 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  35.03 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  34.71 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.23 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  33.83 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  34.18 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  32.29 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  32.85 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  30.04 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  27.83 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  29.97 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  30.18 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  26.19 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  27.06 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  27.44 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  26.14 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  23.58 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  24.52 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  24.03 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0999  hypothetical protein  23.97 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0570483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.13 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.99 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.76 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.34 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0507493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 137 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.24 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.17 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  20.55 
 
 		 291 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.32 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.74 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.74 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  22.73 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.73 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.74 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  28.47 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>