23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1504 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  100 
 
 		 348 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  67.24 
 
 		 348 aa  502  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  67.53 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  29.77 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  28.27 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  28.01 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  29.89 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  28.09 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  24.09 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  28.74 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  25.37 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  28.19 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2432  hypothetical protein  25.31 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14730  hypothetical protein  25.21 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  22.18 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  24.44 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  24.37 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  26.07 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  24.33 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  26.07 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>