19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0999 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0999  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0570483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  24.1 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1113  hypothetical protein  27.02 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  23.78 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  22.09 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  24.89 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.24 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  22.8 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  25.43 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  24.06 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  25.96 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  26.9 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  25.09 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.87 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.7 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  24.86 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  27.69 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.39 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>