37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1113 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1113  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  541  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0999  hypothetical protein  27.59 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0570483  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  24.39 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.9 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  21.83 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  21.83 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.36 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  26.7 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
296 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.25 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093971 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  22.22 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  23.83 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1468  hypothetical protein  36.73 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  24.53 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  23.83 
 
 
292 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  23.83 
 
 
293 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  22.99 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  26.32 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  19.92 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.66 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.28 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  20.08 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.11 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.61 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  25.47 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  23.94 
 
 
343 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  25.11 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  25.11 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  24.77 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  25 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  25.23 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  24.16 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.45 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.14 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.66 
 
 
294 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.14 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>