More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3864 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  27.66 
 
 
364 aa  99.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  32.12 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  28.32 
 
 
322 aa  95.5  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
349 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.74 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  32.75 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  27.17 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  27.49 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  28.88 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  30.53 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  29.11 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.49 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  28.79 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  28.73 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.37 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  30.48 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  27.68 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  30 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  23.39 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  23.34 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  23.55 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.05 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  24.62 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  25.72 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  29.86 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.92 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  29.86 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  26.86 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  23.55 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.68 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  23.39 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  25.91 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.72 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.49 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  28.67 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  24.81 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  28.11 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  28.27 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  24.26 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  30.73 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  29.08 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.42 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  24.05 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  29.51 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  31.11 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  23.21 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  31 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  26.33 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  23.21 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.1 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  22.76 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  22.76 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  22.76 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  27.19 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.05 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  22.76 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  22.76 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.09 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  29.77 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  22.95 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  27.21 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  29.41 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  26.53 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  29.32 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.37 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  28.92 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.39 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  28.51 
 
 
335 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  29.3 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  29.2 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  27.99 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  28.03 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  27.99 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  29.45 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  27.99 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  27.99 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  26.76 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  27.99 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.46 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  27.99 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.532448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>