118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1945 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 318 aa  609  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  55.91 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.42 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.16 
 
 		 347 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  56.04 
 
 		 353 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.72 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  53.31 
 
 		 351 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  49.28 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  49.28 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  49 
 
 		 372 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.41 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  53.25 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  52.8 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.47 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  50.99 
 
 		 372 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  49.55 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  53.29 
 
 		 356 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  53.29 
 
 		 356 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  53.29 
 
 		 396 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  53.97 
 
 		 380 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  53.97 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  51.04 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  51.04 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  49.85 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  52.96 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.84 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  52.96 
 
 		 356 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  52.96 
 
 		 358 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.43 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  52.43 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  48.71 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  48.39 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  48.83 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  50.28 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  49.85 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  52.6 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  46.91 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  38.6 
 
 		 344 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  52.49 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  37.27 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  38.39 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  42.68 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.94 
 
 		 350 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.08 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  39.74 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.69 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  33.44 
 
 		 347 aa  155  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  37.55 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.66 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  38.46 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.78 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.73 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.15 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26.28 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  26.39 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  26.05 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.67 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  30.66 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  31.44 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  27.8 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  29.51 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  26.09 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  26.09 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  26.09 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  26.09 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  26.09 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.09 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  26.13 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  26.8 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  23.86 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  32.35 
 
 		 312 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  29.36 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  30.48 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  25.47 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  26.57 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  31.76 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  26.79 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  31.76 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  26.82 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  31.76 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  31.76 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  31.76 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.76 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  29.36 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.22 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4830  hypothetical protein  26.51 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0481813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  28.22 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  28.22 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.14 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.82 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  28.22 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  26.83 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.82 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  25.47 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.56 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  26.83 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>