62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1337 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  681    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  42.86 
 
 
363 aa  272  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 
358 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  41.11 
 
 
355 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  43.06 
 
 
353 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  41.64 
 
 
352 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  43.41 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.11 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.4 
 
 
356 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 
353 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  46.88 
 
 
349 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  45.24 
 
 
354 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  43.07 
 
 
349 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.07 
 
 
349 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.19 
 
 
348 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  42.12 
 
 
372 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  42.12 
 
 
372 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  42.12 
 
 
372 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  43.06 
 
 
372 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  45.03 
 
 
372 aa  222  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  42.81 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  42.26 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  42.26 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  39.59 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  42.26 
 
 
396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  42.6 
 
 
353 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  41.27 
 
 
350 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  42.56 
 
 
356 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  40.83 
 
 
350 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  41.96 
 
 
358 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  41.96 
 
 
356 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  42.43 
 
 
351 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  42.15 
 
 
351 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.34 
 
 
347 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  41.55 
 
 
354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  35.85 
 
 
347 aa  196  6e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  40.36 
 
 
353 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  40.36 
 
 
353 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.33 
 
 
352 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  37.21 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  39.54 
 
 
357 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  36.04 
 
 
353 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.26 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  40.65 
 
 
280 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  37.17 
 
 
318 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.94 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.01 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.86 
 
 
347 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  43.33 
 
 
352 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 
323 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  35 
 
 
312 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.18 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  24.6 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  27.68 
 
 
294 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.55 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49268  predicted protein  23.29 
 
 
579 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  62.5 
 
 
92 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
301 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>