118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7402 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  79.32 
 
 		 372 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.33 
 
 		 358 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  66.08 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.06 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  52.31 
 
 		 353 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  52.62 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  54.52 
 
 		 354 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.25 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  51.8 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  54.82 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.59 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  52.98 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  52.98 
 
 		 356 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  52.98 
 
 		 356 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  51.39 
 
 		 372 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  51.39 
 
 		 372 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  51.39 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  52.12 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  53.26 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  52.68 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  51.7 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  52.68 
 
 		 358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  52.68 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.86 
 
 		 349 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  50.86 
 
 		 349 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  51.88 
 
 		 351 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  52.98 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  51.74 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  51.69 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  48.96 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  48.96 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  45.83 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.16 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  39.77 
 
 		 355 aa  240  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  42.98 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  37.85 
 
 		 363 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  40.69 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  51.85 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  51.93 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.03 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  44.14 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.73 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  42.37 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.2 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  34.88 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  41.43 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.42 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.15 
 
 		 302 aa  156  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  38.04 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  27.76 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  25.73 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  56.92 
 
 		 92 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.42 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.38 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  29.35 
 
 		 310 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  24.03 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  22.64 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  25.61 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  25.25 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  24.56 
 
 		 301 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  38.67 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  23.58 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  27.32 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  25.54 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.55 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  24.92 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  26.27 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  24.92 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  22.42 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  33.57 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.91 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  24.86 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.12 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.24 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.02 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.02 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  22.07 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.61 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  25.11 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  23.75 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  22.97 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  24.68 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  27.85 
 
 		 303 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.53 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.26 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  24.32 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>