74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2052 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 349 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  61.25 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  61.25 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  61.25 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  60.57 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  51.99 
 
 		 353 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  51.32 
 
 		 352 aa  308  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.43 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  58.29 
 
 		 357 aa  295  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  51.91 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.66 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  52.39 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.65 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  53.12 
 
 		 396 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  53.12 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  53.12 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  51.94 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  49.4 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  53.41 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  52.82 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  52.1 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  52.82 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  52.54 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.82 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  51.88 
 
 		 351 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  52.51 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.01 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  43.07 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  51.2 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  51.2 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  50.72 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  50.58 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.74 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  50.9 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  47.31 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  51.18 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  42.82 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  51.86 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  40.52 
 
 		 355 aa  215  9e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  37.07 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  52.65 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.32 
 
 		 350 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.69 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  36.75 
 
 		 350 aa  182  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  33.44 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  38.96 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  38.32 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.9 
 
 		 302 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  28.09 
 
 		 293 aa  97.1  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  24.89 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30.03 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  44.62 
 
 		 92 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  29.41 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  23.93 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  31.85 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.91 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.41 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.67 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.84 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.67 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.67 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.05 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.8 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.67 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  23.5 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.67 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>