58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1362 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  548  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  54.48 
 
 
363 aa  321  8e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.77 
 
 
356 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  44.24 
 
 
353 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.53 
 
 
348 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.47 
 
 
353 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  45.96 
 
 
356 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  45.96 
 
 
356 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  45.96 
 
 
396 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  46.1 
 
 
356 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  45.59 
 
 
358 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  45.59 
 
 
380 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  45.59 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.6 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  44.16 
 
 
354 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  42.5 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.33 
 
 
350 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  38.77 
 
 
346 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  41.92 
 
 
356 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.24 
 
 
347 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  45.35 
 
 
372 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  39.71 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.29 
 
 
330 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  45.86 
 
 
353 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  40.29 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  39.42 
 
 
349 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.42 
 
 
349 aa  175  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  38.49 
 
 
352 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  42.65 
 
 
350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  40.65 
 
 
372 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  41.2 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  43.07 
 
 
353 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  43.07 
 
 
353 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  41.67 
 
 
351 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.79 
 
 
347 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  39 
 
 
349 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  43.07 
 
 
354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  39.19 
 
 
351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  38.71 
 
 
350 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  41.43 
 
 
356 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.49 
 
 
323 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  39.37 
 
 
372 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  39.37 
 
 
372 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  39.37 
 
 
372 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  38.4 
 
 
353 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
352 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  42.92 
 
 
312 aa  152  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  44.18 
 
 
352 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 
318 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  30.71 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.09 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.41 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  25.34 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26.32 
 
 
333 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  43.48 
 
 
92 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  36.29 
 
 
335 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  31.82 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  26.76 
 
 
304 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>