84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3480 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  59.38 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  59.38 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  59.38 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  61.25 
 
 		 350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.14 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  59.14 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  51.27 
 
 		 352 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.39 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.64 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  53.09 
 
 		 353 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.33 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  54.07 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  54.07 
 
 		 396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  54.07 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  53.09 
 
 		 372 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  49.71 
 
 		 349 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  54.97 
 
 		 380 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  54.07 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  53.78 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  53.78 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  52.34 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  52.27 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  50.29 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  53.76 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  52.54 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  53.06 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  53.06 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  50.15 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  52.11 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  42.05 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.08 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  50 
 
 		 354 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  40.69 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  35.23 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  45.35 
 
 		 353 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  45.51 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  38.02 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  51 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  39.77 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.66 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  50.29 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.59 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.57 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.69 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  40.49 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.54 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  31.06 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.67 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  36.21 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.87 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  29.1 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  23.16 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  50.77 
 
 		 92 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.55 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.18 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 286 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 292 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.36 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  25.73 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  30.04 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.01 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.89 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.64 
 
 		 289 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  34.48 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  25.48 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  21.76 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  24.5 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  29.53 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  27.67 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  30.56 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  29.23 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  31.54 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.35 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  27.62 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  27.62 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.02 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.78 
 
 		 325 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.78 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.08 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  25.46 
 
 		 335 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>