99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2015 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 323 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  95.05 
 
 		 330 aa  554  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  65.94 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.39 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  43.47 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  44.89 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.37 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.2 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.53 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  42.11 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  43.9 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.2 
 
 		 353 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  44.38 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  45.32 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  44.38 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  44.38 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  41.16 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  42.81 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  40.61 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  40.61 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  40.61 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  40.91 
 
 		 356 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  43.64 
 
 		 350 aa  195  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  40.3 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  40.3 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  36.64 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  42.2 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  40.85 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  40.85 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  38.75 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  39.81 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  36.31 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  35.81 
 
 		 347 aa  179  8e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  44.04 
 
 		 372 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  36.28 
 
 		 344 aa  175  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  40.21 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  39.7 
 
 		 351 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.98 
 
 		 347 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  41.14 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  37.13 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  38.3 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  40.95 
 
 		 354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  38.04 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.35 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  37.68 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  41.44 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  42.28 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.23 
 
 		 351 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  34.36 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  28.03 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.35 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  24.91 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.17 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  25.84 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.81 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.27 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.37 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.44 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.44 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.44 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  25.09 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.97 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.44 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  25.81 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  25.81 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.63 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.78 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.19 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  24.13 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.47 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.55 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  26.9 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  26.9 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.12 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  26.4 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  24.66 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  23.48 
 
 		 287 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.27 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  26.5 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  24.5 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  23.68 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.7 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  27.94 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.56 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  25.88 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.09 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  31.3 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  24.07 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  27.59 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  22.97 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>