60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0033 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  727    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  54.48 
 
 
280 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  41.36 
 
 
344 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  40.29 
 
 
355 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.8 
 
 
358 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.23 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  40.34 
 
 
353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.52 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  42.6 
 
 
354 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.94 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  41.72 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  40.12 
 
 
356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.78 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  37.57 
 
 
352 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  38.59 
 
 
372 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  40.29 
 
 
356 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  40.29 
 
 
396 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  40.29 
 
 
356 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  38.99 
 
 
350 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  40.59 
 
 
356 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  40 
 
 
358 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  40 
 
 
356 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  36.83 
 
 
372 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  34.53 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  34.53 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  39.94 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  34.25 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  37.54 
 
 
351 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  36.83 
 
 
356 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  37.71 
 
 
350 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.78 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  36.78 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  36.57 
 
 
346 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  38.04 
 
 
349 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  33.24 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
347 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  37.43 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  37.72 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  37.72 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  33.13 
 
 
347 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.89 
 
 
302 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  33.6 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  37.72 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  36.08 
 
 
312 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  33.63 
 
 
353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.67 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.32 
 
 
347 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  36.81 
 
 
352 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 
323 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.35 
 
 
351 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  37.83 
 
 
318 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.03 
 
 
293 aa  100  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  39.44 
 
 
92 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  24.42 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  26.13 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  25.15 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 
294 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 
286 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.75 
 
 
301 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>