61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6663 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  92.63 
 
 
353 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  89.8 
 
 
372 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  97.45 
 
 
353 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  97.45 
 
 
353 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  90.08 
 
 
353 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  69.63 
 
 
356 aa  454  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.69 
 
 
353 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  72.54 
 
 
356 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  72.54 
 
 
356 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  71.91 
 
 
396 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  73.57 
 
 
380 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  72.24 
 
 
356 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  71.64 
 
 
354 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  72.24 
 
 
358 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  72.24 
 
 
356 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.06 
 
 
356 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  63.27 
 
 
351 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  63.1 
 
 
351 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.8 
 
 
352 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.82 
 
 
348 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  58.56 
 
 
350 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  52.84 
 
 
352 aa  338  9e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  63.29 
 
 
354 aa  332  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.71 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  67.06 
 
 
352 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  55.77 
 
 
350 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  50.7 
 
 
372 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  50.7 
 
 
372 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  50.7 
 
 
372 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  51.47 
 
 
349 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.85 
 
 
349 aa  289  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  50.85 
 
 
349 aa  289  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  52.74 
 
 
372 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.03 
 
 
347 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  45.14 
 
 
346 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  52.01 
 
 
356 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  52.37 
 
 
357 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  39.94 
 
 
363 aa  245  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  54.79 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  41.45 
 
 
344 aa  242  6e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  38.97 
 
 
355 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.26 
 
 
350 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.33 
 
 
347 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.18 
 
 
330 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  36.6 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  43.43 
 
 
280 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.95 
 
 
323 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  31.87 
 
 
347 aa  167  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.97 
 
 
302 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  35.92 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.45 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.13 
 
 
293 aa  96.7  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  24.22 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  52.31 
 
 
92 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  28.27 
 
 
311 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  27.31 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  27.75 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  29.67 
 
 
338 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.36 
 
 
315 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 
302 aa  43.1  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>