82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1548 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  71.63 
 
 
353 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.43 
 
 
353 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  73.57 
 
 
380 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  71.35 
 
 
372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  73.43 
 
 
356 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  73.43 
 
 
396 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  73.43 
 
 
356 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  73.13 
 
 
356 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  73.13 
 
 
358 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  72.03 
 
 
354 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  73.73 
 
 
356 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  71.63 
 
 
353 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.5 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  71.35 
 
 
353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  71.35 
 
 
353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  70.22 
 
 
353 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  64.94 
 
 
351 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  60.96 
 
 
350 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  65.88 
 
 
351 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.47 
 
 
348 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  54.83 
 
 
352 aa  342  5.999999999999999e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  61.14 
 
 
354 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.57 
 
 
352 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.89 
 
 
358 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  52.34 
 
 
372 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  52.34 
 
 
372 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  52.34 
 
 
372 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  64.09 
 
 
352 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  55.34 
 
 
350 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.7 
 
 
347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  52.65 
 
 
349 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  54.2 
 
 
372 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.27 
 
 
349 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  48.27 
 
 
349 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  44.73 
 
 
346 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  50.87 
 
 
356 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  42.9 
 
 
344 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  56.45 
 
 
318 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  40.91 
 
 
363 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  49.44 
 
 
357 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.96 
 
 
347 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  41.01 
 
 
355 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.49 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.29 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  37.18 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.94 
 
 
323 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  40.73 
 
 
280 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  32.34 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.99 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.87 
 
 
351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  33.57 
 
 
312 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.19 
 
 
293 aa  99.8  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  25.7 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  53.85 
 
 
92 aa  63.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.25 
 
 
311 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.64 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.04 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  30.95 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  48.44 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.06 
 
 
315 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  27.01 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  23.32 
 
 
301 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  24.12 
 
 
301 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.44 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  22.34 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  25 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  30.37 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  30.37 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  27.6 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  25.14 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  32.53 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  32.53 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  23.64 
 
 
301 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.88 
 
 
348 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  33.72 
 
 
305 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  23.64 
 
 
301 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  27.96 
 
 
320 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>