66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1044 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  100 
 
 		 352 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  81.82 
 
 		 352 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  67.44 
 
 		 353 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.9 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  72.16 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.51 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  73.01 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  67.66 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  63.86 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  69.67 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  68.31 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  68.36 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  68.36 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  68.36 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  68.06 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  68.06 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  68.06 
 
 		 358 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  65.91 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  69.14 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  67.9 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  66.37 
 
 		 353 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  66.37 
 
 		 353 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.82 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  55.43 
 
 		 352 aa  346  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.62 
 
 		 358 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  57.96 
 
 		 353 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  54.96 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  54.96 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  54.96 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  56.73 
 
 		 350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  53.25 
 
 		 349 aa  297  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  56.4 
 
 		 372 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.59 
 
 		 347 aa  290  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  53.03 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.03 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  50.29 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  56.77 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  45.51 
 
 		 346 aa  242  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  43.48 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  52.38 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  37.71 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  39.77 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.77 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.7 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 		 350 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  36.44 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  43.07 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.6 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  32.5 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  37.32 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.29 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  31.42 
 
 		 293 aa  106  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26.62 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  50.77 
 
 		 92 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.54 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.19 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  28.57 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.76 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  21.74 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  27.8 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  26.71 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.67 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  27.8 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  27.8 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>