70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3456 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.36 
 
 		 330 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.94 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.65 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  46.29 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.85 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.68 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  43.24 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  45.48 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  46.29 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  45.21 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.54 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  45.21 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  45.21 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  44.91 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  43.7 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  44.91 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.91 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  44.91 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  47.83 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.79 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  46.88 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  42.52 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.52 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  45.12 
 
 		 350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  43.02 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  43.02 
 
 		 372 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  43.02 
 
 		 372 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  45.62 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  43.86 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  45.62 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  36.21 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  34.18 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  40.92 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  42.65 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  39.83 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  36.34 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  44.19 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  42.05 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  34.63 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.61 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  40.92 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  37.76 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  38.11 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  46.72 
 
 		 352 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.91 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  39.66 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  38.27 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  41.27 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.67 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.22 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  29.78 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  26.55 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.21 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  27.23 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  27.23 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  28.67 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  33.71 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  22.8 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  27.75 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  26.44 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.9 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.45 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  46.15 
 
 		 92 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  26.99 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  27.64 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  20.74 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>