100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0463 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  660    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  26.78 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  24.71 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  27.67 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  26.7 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  28.85 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  29.52 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  25.59 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  27.62 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  24.77 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  25.31 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  27.86 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  25.27 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  26.94 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  23.75 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  25.38 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  23.75 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  23.75 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  24.73 
 
 
353 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 
323 aa  59.3  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  25 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  25 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  25 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  22.98 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  25.6 
 
 
380 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  26.44 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  24.6 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 
315 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  25.13 
 
 
353 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  25.13 
 
 
353 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  22.27 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.77 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  25 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  25 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  24.34 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 
287 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  26 
 
 
346 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0433  hypothetical protein  23.24 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.83 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  24.23 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  22.91 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  22.54 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  24.26 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.24 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  23.11 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  22.3 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  24.16 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.2 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  23.53 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  25.84 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  23.24 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  24.17 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.12 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  26.48 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  23.19 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  19.71 
 
 
319 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  21.59 
 
 
320 aa  46.2  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  21.07 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.11 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  27.97 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.69 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  23.4 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.87 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  25.11 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.59 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.87 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  25.11 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  23.44 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 
287 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 
289 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  21.88 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  25.11 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  26.59 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  23.86 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  23.19 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  20.38 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0432  hypothetical protein  23.46 
 
 
296 aa  42.7  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>