79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0920 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  283  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  45 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  46.43 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  48.48 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  47.41 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  46.4 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  48.51 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  48.51 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  48.51 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  44.68 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  39.68 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  41.43 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18310  hypothetical protein  42.98 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1587  hypothetical protein  45.28 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2531  hypothetical protein  34.35 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2488  hypothetical protein  34.35 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  36.57 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  36.57 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2647  hypothetical protein  35.11 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  46.97 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2543  hypothetical protein  35.11 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.141618  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2439  hypothetical protein  35.11 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  44.44 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  46.97 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  46.97 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  34.38 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  46.97 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  34.45 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  33.86 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  44.64 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  47.46 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.33 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  44.62 
 
 		 121 aa  47.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  31.97 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  35.25 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31.15 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  35.59 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  52.38 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  35.14 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.58 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  40.28 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  31.11 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  42.37 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3401  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02144  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02185  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1399  conserved hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2555  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.580251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  25.96 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  42.59 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  34.92 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2404  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.920448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1390  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  34.33 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  34.33 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2414  hypothetical protein  34.53 
 
 		 128 aa  42  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  36.62 
 
 		 121 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  30.89 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  42.11 
 
 		 111 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>