32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_18310  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  260  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12324  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1587  hypothetical protein  93.38 
 
 
137 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  61.87 
 
 
134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  59.06 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  43.08 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  42.64 
 
 
128 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  42.64 
 
 
128 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  47.24 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  42.64 
 
 
128 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  47.29 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  43.65 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  44.44 
 
 
130 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  41.46 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  40.44 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2414  hypothetical protein  36.07 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2488  hypothetical protein  37.84 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2543  hypothetical protein  37.84 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.141618  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2531  hypothetical protein  37.84 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2439  hypothetical protein  37.84 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2647  hypothetical protein  37.84 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02144  hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1399  conserved hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3401  hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1390  hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2555  hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.580251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2404  hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.920448  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02185  hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  29.51 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  32.18 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2890  hypothetical protein  59.38 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  26.13 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.318162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>