28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2531 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2531  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  236  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2488  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  236  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2647  hypothetical protein  98.4 
 
 
125 aa  232  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2439  hypothetical protein  98.4 
 
 
125 aa  232  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2543  hypothetical protein  98.4 
 
 
125 aa  232  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.141618  normal  0.699642 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1399  conserved hypothetical protein  67.2 
 
 
128 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02144  hypothetical protein  67.2 
 
 
128 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02185  hypothetical protein  67.2 
 
 
128 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2414  hypothetical protein  67.2 
 
 
128 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1390  hypothetical protein  68.03 
 
 
128 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2555  hypothetical protein  66.4 
 
 
128 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.580251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2404  hypothetical protein  68.03 
 
 
128 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.920448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3401  hypothetical protein  66.4 
 
 
128 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  43.2 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  44.07 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  40.48 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  43.22 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  39.17 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  37.21 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  36.44 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  36.44 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  36.44 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  37.17 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  34.45 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  32.74 
 
 
114 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  32.74 
 
 
114 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18310  hypothetical protein  39.36 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>