38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2847 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  256  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  61.94 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18310  hypothetical protein  61.15 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1587  hypothetical protein  60.58 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  48.84 
 
 		 130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  49.21 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  46.46 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  46.28 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  47.41 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  45.38 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2531  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2488  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2647  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2439  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2543  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.141618  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02144  hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02185  hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1399  conserved hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3401  hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1390  hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2555  hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.580251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2404  hypothetical protein  36.44 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.920448  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2414  hypothetical protein  35.59 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  35.21 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  26.02 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  38.24 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  28.97 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2890  hypothetical protein  48.08 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0309406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  38.81 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  41.27 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  36.51 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  36.51 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  35.71 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  35.38 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>