56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4230 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4230  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  253  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  74.24 
 
 
132 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2073  hypothetical protein  52.89 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  48.76 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  46.51 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  48.33 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  48.33 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  48.33 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  45.74 
 
 
130 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  46.46 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2543  hypothetical protein  44.07 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.141618  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2439  hypothetical protein  44.07 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2647  hypothetical protein  44.07 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2531  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2488  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18310  hypothetical protein  52.34 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12324  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2414  hypothetical protein  43.22 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.922978  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02144  hypothetical protein  42.37 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1399  conserved hypothetical protein  42.37 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02185  hypothetical protein  42.37 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1587  hypothetical protein  57.14 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3401  hypothetical protein  42.37 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2555  hypothetical protein  42.37 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.580251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2404  hypothetical protein  42.37 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.920448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1390  hypothetical protein  42.37 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  41.73 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  37.96 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  33.09 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  33.09 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  40 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  33.86 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.07 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  41.18 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  32.46 
 
 
123 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  39.73 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.03 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  27.35 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.3 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  28.07 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  23.53 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  32.2 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  40.3 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  40.3 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  32.74 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  32.74 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  32.74 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  34.23 
 
 
123 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>