42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2416 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  222  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  38.95 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  38.95 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  30.69 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  39.58 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  38.83 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.66 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  28.85 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  36.23 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  30.7 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  28.45 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  33.77 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  33.9 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  31.96 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  40.96 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  37.84 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  33.68 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  36.79 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  35.51 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  28.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  32.26 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  29.57 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  34.26 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  34.18 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  34.26 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  28.95 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  23.15 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  32.29 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  32.63 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  28.83 
 
 		 126 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  37.93 
 
 		 115 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  41.07 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.72 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>