73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1730 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1730  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 		 114 aa  223  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2607  SMR family multidrug efflux pump  99.12 
 
 		 114 aa  221  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1836  hypothetical protein  98.25 
 
 		 114 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  65.14 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2923  small multidrug resistance protein  58.72 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1355  small multidrug resistance protein  55.05 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  52.13 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  51.35 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2438  inner membrane protein YfbW  51.55 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2530  inner membrane protein YfbW  51.55 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2542  hypothetical protein  51.55 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373163  normal  0.593435 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2487  inner membrane protein YfbW  51.55 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  47.75 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  50.93 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2646  inner membrane protein YfbW  50.52 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  46.39 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  42.86 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  33.63 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  29.57 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  29.57 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  29.51 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  50.91 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  41.58 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  42.86 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  44.05 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.56 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2695  hypothetical protein  39.53 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0116766  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  36.96 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  38.27 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  40.68 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  39.6 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  40.79 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  26.5 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  28.85 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  29.7 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  26.5 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  26.5 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  26.5 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  31.67 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  31.67 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  27.5 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  40.74 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  40.74 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  32.65 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  40.74 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  26.67 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29344  predicted protein  31.37 
 
 		 317 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  32.53 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  31.09 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  34.38 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  38.6 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  30 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  33.33 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2847  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>