39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0451 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0451  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 116 aa  214  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.580088  hitchhiker  0.00482726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  34.86 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  29.73 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  29.31 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  30.63 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  30.63 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  43.24 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  29.73 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  28.45 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  35.71 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  29.31 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  29.31 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  29.31 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  26.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  27.1 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  36.99 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  36.99 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  36.99 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  29.73 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3637  small multidrug resistance protein  32.76 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  32.43 
 
 		 109 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1265  small multidrug resistance protein  29.33 
 
 		 104 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  38.03 
 
 		 130 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  31.48 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  26.72 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  26.72 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  28.07 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  28.07 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  28.07 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  28.07 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  28.07 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  30.88 
 
 		 114 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>