More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3074 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 109 aa  207  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 110 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  47.31 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  47.31 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  46.94 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  41.84 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  46.24 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  41.67 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  46.46 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  43.43 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 291 aa  80.1  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.37 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  45.16 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  42.86 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.09 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  45.74 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  44.09 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  44.09 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  43.43 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.84 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  45.16 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.62 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.62 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  44.09 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  42.27 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06909  hypothetical protein  39.8 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  41.84 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  40.82 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  46.46 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  40.62 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  44.79 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  42.35 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  42.27 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1516  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  51.22 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  51.22 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  51.22 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  42.42 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  39.58 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0613  small multidrug resistance protein  47.56 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  42.55 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  38.14 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  42.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  38.14 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  42.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  42.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  42.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.54 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  42.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  42.55 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  43.01 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  40.43 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  40.43 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  44.44 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  40.43 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  42.71 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  38.71 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  41.49 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  41.49 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>