More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1476 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  100 
 
 		 108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  67.62 
 
 		 107 aa  147  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  55.66 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  56.19 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  53.06 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  48.08 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  48.08 
 
 		 120 aa  103  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  48.08 
 
 		 120 aa  103  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  48.08 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  47.12 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  47.12 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  45.71 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  43.93 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  36.27 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  40.38 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  40.38 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  40.38 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  40.38 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  40.38 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  40.38 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  39.42 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  39.42 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.71 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.39 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  46.39 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  46.39 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  39.42 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  43.3 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  44.05 
 
 		 100 aa  84  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  40 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  46.15 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  43.52 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  45.35 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.05 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.76 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.76 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.05 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.05 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.05 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  40.2 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  42.45 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.05 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.05 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  37.14 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  37.14 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  45.36 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  36.27 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  44.79 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  37.74 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  48.72 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  39.05 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>