More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2083 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  203  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  54.21 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  52.34 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  53.27 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  53.27 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  52.34 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  52.34 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  56.86 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  52.94 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  47 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  44.23 
 
 		 107 aa  95.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  43.27 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  43.27 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  43.27 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  43.27 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  43.27 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  43.27 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  43.27 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  43.27 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  45.54 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  44.55 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  44.55 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.14 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  45.35 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  44.55 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  39.45 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.06 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  43.56 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.86 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  43.56 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.86 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  43 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  44.79 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  44 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  44.33 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  44 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  42.16 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  45.36 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  42 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  41.58 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.57 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  41.49 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  41.49 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  40 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  41.77 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  42.16 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  39.05 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  36.79 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  39.42 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  42.16 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  38.1 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  35.71 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2599  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>